父亲和长老们商量如何在家组织佛门功法的传承。玉小刚本打算继续在火影世界的化身修行，结果入梦之后发现进入火影世界的门进入技能冷却状态。因此只好先进入eva世界化身成为碇真嗣。
片刻后，碇真嗣坐在葛城美里驾驶的前往NERV总部的车上，心中思绪万千。曾经无数次在EVA世界中战斗，每一次都拼尽全力，却始终未能获得足以改变现实命运的力量。那些梦境中的生死挣扎、痛苦与迷茫，如同潮水般在他脑海中翻涌。
而这一次，他选择从小就亲近佛教，从东京当地的寺庙听闻《观无量寿佛经》的讲解，受三皈五戒并取法名重仁后。他期望佛门的观想法或许能成为新的力量源泉，让自己能走出一条以前不同的道路，同时也能获得可以被斗罗大陆的自己继承的力量。
车窗外，城市的景象飞速掠过，重仁的眼神却始终坚定而深邃。他默默在心中复盘着碇源堂和SEELE的情况。碇源堂，这个男人，看上去冷漠无情，实则一心只为了见到妻子碇唯，甚至不惜将自己的儿子当作实现目的的工具。但在重仁看来，他虽然性格恶劣，但并非完全不可救药。毕竟，他是自己这具身体的父亲，那份血缘的联系，以及他内心深处对妻子的执着，让重仁觉得，或许可以通过谈判拉拢他，让他站在自己这一边，共同对抗更强大的敌人SEELE。
至于SEELE，重仁的眼神中闪过一丝寒意。这群打着宗教幌子的家伙，简直就是反人类的刽子手。他们妄图通过屠杀全人类来达成自己融入所谓的神国的目的，这种疯狂的行为绝不能被容忍。每一次想到SEELE的阴谋，重仁都感到一股怒火在心中燃烧。这帮冢中枯骨，我早晚把他们都收拾了。
重仁看着熟悉的NERV入口的环境映入眼帘，想着，从现在起我是碇真嗣。
“真嗣，到了。”葛城美里的声音将真嗣从思绪中拉了回来。他深吸一口气，缓缓走下车。NERV总部那熟悉的建筑矗立在他面前，散发着一种压抑而神秘的气息。
走进总部，周围的工作人员行色匆匆，每个人的脸上都写满了紧张和焦虑。真嗣知道，使徒的威胁又近了。他跟随葛城美里来到指挥室，碇源堂那冷峻的面容出现在大屏幕上。
“真嗣，你必须驾驶初号机出击。”碇源堂的声音没有一丝温度，仿佛只是在下达一个普通的命令。
真嗣紧紧握着拳头，努力让自己镇定下来。他抬起头，直视着屏幕中的碇源堂，说道：“我会出击，但等我回来之后，我们需要谈谈，谈一个你一定会感兴趣的话题。”
NERV总部内，警报声如催命符般急促而尖锐地响彻每一个角落。灯光闪烁不定，映照在工作人员们紧张而苍白的脸上，气氛压抑得令人窒息。碇真嗣被一群神色匆匆的工作人员带到了初号机的驾驶舱前。
望着这个寄居着碇唯灵魂的机体，碇真嗣觉得熟悉又安心。
进入初号机之后，碇真嗣深吸一口气，努力让自己镇定下来，尽管心跳依旧如鼓点般急促。他缓缓走进驾驶舱，当舱门关闭的瞬间，一种奇异的熟悉感涌上心头。这是多次在梦境中驾驶初号机的感觉，而这一次，是他要做出改变。
他很快与初号机内碇真嗣母亲的灵魂产生了同步，这种奇妙的联系让他仿佛拥有了无尽的力量。
水天使那庞大的身躯在城市中肆虐，人类的装甲火力在它面前就像蝼蚁面对巨象，轻易就被击溃，爆炸声此起彼伏，碎片四处飞溅。
凭借着多次梦境中操控初号机和水天使对战积累的宝贵经验，碇真嗣迅速熟悉了操作，初号机在他的操控下如同一头觉醒的巨兽，向着水天使猛扑过去。
但碇真嗣驾驶着初号机却如入无人之境，灵活地躲避着水天使的攻击，同时发动凌厉的反击。
初号机的手臂如同两把锋利的长刀，一次次精准地斩向水天使。同时开启自身AT立场中和水天使的AT立场。水天使的身上很快就布满了伤痕，蓝色的血液四处飞溅，它发出愤怒而痛苦的咆哮，却始终无法摆脱初号机的攻击。
然而，受伤的水天使开始发狂反击。它的手肘周围突然爆发出一阵强烈的光芒，原本就狰狞的面容变得更加扭曲恐怖。它伸直手臂，从手掌心射出一道凌厉的能量光剑，向着初号机疯狂扫射。
初号机在密集的攻击下开始有些应接不暇，碇真嗣能感觉到机体的震动越来越剧烈，操控也变得有些吃力。他的额头布满了汗珠，眼神却依然坚定。
这一次碇真嗣不打算杀死水天使，而是运用起《观无量寿佛经》里的日观之法。他努力让自己排除外界的一切干扰，集中精神。在他的眼前，一轮巨大的夕阳缓缓浮现，那绚烂的橙红色光芒将整个驾驶舱都染成了温暖的红色。夕阳的余晖洒在他的身上，仿佛给予了他无尽的力量。
光芒之中，母亲碇唯的身影出现。她略感惊讶，儿子居然拥有让只剩下灵魂的自己现形的能力。她虽然有很多话想说，但是也明白现在的主要任务是对付水天使。于是碇唯调动自己的灵魂力量驱使初号机的AT力场，一边招架水天使的进攻，一边将碇真嗣观想出来的夕阳实体化。
随着碇真嗣和碇唯的意念，初号机的AT立场开始发生变化。原本二维的立场逐渐变得越来越厚实，并且开始按照他的想象，形成太阳的形态并放出光芒。那光芒越来越强烈，越来越耀眼，仿佛真的是一颗夕阳悬停在初号机周围。
当光芒达到极致时，初号机周围爆发出一阵强大的能量波动。这突如其来的光芒形成一个领域，将正在狂暴进攻的水天使包裹其中。水天使原本凶狠的眼神中露出了一丝惊恐，它的攻击瞬间停滞，身体也被这光芒压制得难以继续攻击。
他微微闭上双眼，内心一片澄明，将自己多年来听经闻法，积累的对佛法的感悟与理解，化作一股无形的精神力量，通过领域，悄然传递给了水天使。
碇真嗣深吸一口气，集中全部精神，借助初号机那神秘而强大的 AT力场，将“众生本具如来智慧德相”的佛法真谛化作一道道无形的波纹，向水天使的意识深处涌去。
“水天使，你听着！”碇真嗣的声音通过 AT立场，如同洪钟大吕般在水天使的脑海中炸响，“亚当虽然是你的生命之源，可它复苏之时，便是人间炼狱开启之日。无数生灵涂炭，山河破碎，这便是你一心想要回归的亚当带来的危害！你作为独立个体，应该追寻充满智慧，与其他生命和谐相处的生活方式。”
水天使的身体猛地一震，眼中闪过一丝挣扎。它本能地想要反驳，却发现自己的思维仿佛被一股无形的力量束缚，只能任由碇真嗣的话语在脑海中不断回荡。
碇真嗣见状，双手快速合十，初号机周身的日观光芒陡然大盛，如同一轮炽热的太阳，将整个城市照得亮如白昼。强大的能量波动以初号机为中心，向四周疯狂扩散，掀起一阵阵狂暴的气流。
“我本不愿动武，但你若执迷不悟，我也有的是手段消灭你！”碇真嗣的声音中带着一丝不容置疑的威严，“现在，放下你那回归亚当的本能渴望，好好听听我的话！”
一时间夕阳的光芒加强，射入水天使身体内，将它完全压制。
水天使由于失去了对身体的掌控，无法做出进攻，它的身体开始不受控制地颤抖起来，周身的紫色光芒也变得忽明忽暗。在碇真嗣的佛法点化与武力威慑之下，它内心深处那股强烈的本能渴望开始动摇。
碇真嗣趁热打铁，继续说道：“亚当曾经的复苏，让人类陷入了艰难的境地，人口大量死亡，大量野生动物死亡，自然环境被破坏。你作为亚当的子嗣，有义务修复这一切。尽你所能，去修复被破坏的环境，这才是你存在的意义！”
水天使的眼中闪过一丝犹豫，随后又闪过一丝迷茫，但紧接着，一丝坚定悄然浮现。它似乎听懂了碇真嗣的话，虽然智力有限，但它也隐隐感觉到，自己或许真的走错了方向。
这些交流在对除了碇真嗣以外的人都保密，外界看来，碇真嗣制服数天数水天使只是一个瞬间发生的事情，但在碇真嗣的精神世界里，却仿佛经历了一场漫长的旅程。
突然，碇真嗣感觉到一股奇异的精神波动传来，那是水天使通过自己的精神力向他传递的信号。在精神层面，他“看”到了水天使传达出的同意意愿，那是一种毫无保留的认可。碇真嗣心中一喜，他知道，这是关键的一步。
碇真嗣小心翼翼地操控着这团由AT力场化成的夕阳，缓缓地向水天使推去。夕阳一点点地靠近水天使，最终顺利地进入了它的体内。
在精神世界中水天使的体型与现实世界形成了巨大反差，身高不过20厘米，在碇真嗣观想的夕阳面前小得像一只蚂蚁。“这应该是使徒们只有力量果实，没有智慧果实的后果。”
碇真嗣控制夕阳放出的光芒在水天使精神空间内刻下一首诗：
【日观】
第一观门名日观，遥观落日向西悬。
光明了了同金鼓，轮相团团挂碧天。
身去身来心不昧，眼舒眼合意常缘。
众生与佛无差别，即见弥陀现我前。
这些文字深深地印刻在水天使的精神空间，建立了碇真嗣和水天使之间的精神联系。
碇真嗣通过这种联系，向水天使传达着自己的想法：“从现在起，我就住进了你的精神空间，这样我就可以随时和你取得联系。如果你反悔，还想进攻并毁灭人类，我随时能消灭你。”
水天使似乎听懂了碇真嗣的话，它巨大的身躯微微颤动了一下，发出一阵低沉而温和的精神波动，像是在回应碇真嗣的警告。
做完这一切，碇真嗣长舒了一口气。而在外界，初号机将AT力场化成的夕阳送入水天使体内后，水天使立刻有了动作。它那庞大的身躯快速地扭动起来，向着海边狂奔，带起一阵狂风。紧接着，它如同一颗流星般，一头扎进了下方的海洋。
海水被它的冲击力掀起巨大的浪花，仿佛一座瞬间崛起的水墙。水天使的身影迅速消失在海浪之中，向着海洋远处游去，水天使却毫无阻碍地继续前行，很快就消失在了人们的视线之外。
在驾驶初号机返回总部的过程中，碇真嗣坐在驾驶舱内，眼神中透露出一丝迷茫却又坚定的光芒。他集中精神，凭借着之前与母亲建立的精神联系，缓缓地开启了与母亲碇唯的精神交流。
在精神的世界里，一切都变得无比清晰和真实。碇唯的身影出现在碇真嗣的面前，她的面容依旧温柔，眼神中充满了慈爱。碇真嗣看着母亲，心中涌起一股暖流，但很快，他的神情又变得严肃起来。
“母亲，我反对SEELE组织的人类补完计划。”碇真嗣的声音在精神世界中回荡，带着一种不容置疑的坚定。
碇唯微微一愣，眼中闪过一丝惊讶，她轻声问道：“真嗣，你为什么会知道人类补完计划？这可不是你能轻易了解的事情，是你父亲告诉你的吗？”
碇真嗣犹豫了一下，然后说道：“母亲，这是我在梦中见到的。在梦里，我看到了SEELE的计划，他们想要通过人类补完计划，将所有的人类融合成一个整体，抹杀掉个体的差异和自由。但我认为，这并不是真正的拯救，而是对人类的一种毁灭。”
碇唯静静地听着儿子的话，眼神中流露出一丝复杂的神情。她很难理解儿子所说的这些话，毕竟人类补完计划在SEELE对内的宣传中，一直是一个为了人类未来而进行的伟大计划。但她能感受到儿子话语中的真诚和担忧。
“真嗣，那你有什么想法呢？”碇唯轻声问道。
碇真嗣的眼神变得更加明亮，他说道：“母亲，我希望能够缔造一个人类和使徒和平相处的时代。使徒并不是我们的敌人，它们也有自己的生存权利。我们不应该用武力去消灭它们，而是应该寻找一种和平共处的方式。只有这样，人类才能真正地走向未来。”
碇唯看着儿子，心中既惊讶又欣慰。惊讶的是儿子竟然有如此超前的想法，欣慰的是儿子有着一颗善良和勇敢的心。她沉思了片刻，然后说道：“真嗣，你的想法很美好，但实现起来恐怕会非常困难。SEELE的势力庞大，他们不会轻易放弃人类补完计划的。”
碇真嗣点了点头，说道：“我知道，母亲。但我还是想试一试。而且，我希望你能帮助我，说服父亲也站在我的这一边。父亲在NERV和SEELE中都有着重要的地位，如果他能支持我，我们的计划就有更大的可能实现。”
碇唯看着儿子那充满期待的眼神，心中一阵柔软。她虽然很难理解儿子所说的一切，但她相信儿子的判断和选择。她决定支持儿子的想法，哪怕前方充满了未知和困难。
“真嗣，母亲答应你。我会尽力去劝说你的父亲，让他明白你的想法。但你要知道，你父亲是一个非常固执的人，他可能不会轻易改变自己的观点。”碇唯轻声说道。
碇真嗣的脸上露出了欣慰的笑容，他说道：“母亲，谢谢你。不管结果如何，我都会努力去争取的。我相信，只要我们坚持下去，就一定能够实现和平的梦想。”
在精神的世界里，母子俩紧紧地相拥在一起，仿佛在这一刻，他们拥有了无穷的力量。而在现实世界中，初号机依然静静地伫立着，等待着未来的挑战。碇真嗣知道，从这一刻起，他踏上了一条充满荆棘的道路，但他不会退缩，因为他有母亲的陪伴和支持，有自己心中那坚定的和平信念。